Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF180Q9UJW8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF180Q9UJW8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms