Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms