Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX25Q9UHL0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX25Q9UHL0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX25Q9UHL0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX25Q9UHL0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX25Q9UHL0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX25Q9UHL0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX25Q9UHL0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX25Q9UHL0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX25Q9UHL0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX25Q9UHL0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX25Q9UHL0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX25Q9UHL0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX25Q9UHL0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms