Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS29Q9UBQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS29Q9UBQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms