Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PPARGC1AQ9UBK2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms