Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL2Q9UBD3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms