Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms