Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CC2D2AQ9P2K1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC38■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC38■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC38■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms