Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC88CQ9P219 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms