Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMG20BQ9P0W2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms