Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMOD4Q9NZQ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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