Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTEL1Q9NZ71 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms