Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53CQ9NYF3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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