Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBA8Q9NY65 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TUBA8Q9NY65 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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