Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMPD3Q9NY59 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.9 ms