Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD8Q9NX08 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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