Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLE1Q9NVX2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NLE1Q9NVX2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms