Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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