Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms