Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PDS5BQ9NTI5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.8 ms