Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ABCC13Q9NSE7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC13Q9NSE7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC13Q9NSE7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC13Q9NSE7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC13Q9NSE7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC13Q9NSE7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC13Q9NSE7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms