Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPRMQ9NS64 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms