Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPHNQ9NQX3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms