Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31BQ9NQW1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31BQ9NQW1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms