Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQI0

DDX4, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX4Q9NQI0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX4Q9NQI0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX4Q9NQI0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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