Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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