Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VTA1Q9NP79 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTA1Q9NP79 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms