Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms