Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE7BQ9NP56 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE7BQ9NP56 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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