Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX1Q9NP08 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms