Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LY9Q9HBG7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LY9Q9HBG7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms