Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOBPQ9H2D6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms