Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms