Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms