Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSG1Q9H089 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSG1Q9H089 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSG1Q9H089 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms