Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HOXD1Q9GZZ0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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