Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BHLHE41Q9C0J9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms