Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP44Q9C0F1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms