Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms