Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM4Q9C037 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms