Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP1Q9C000 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms