Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3CQ9BUI4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms