Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA3Q9BTC8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA3Q9BTC8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms