Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms