Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UTP23Q9BRU9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UTP23Q9BRU9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms