Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGIP1Q9BQI5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGIP1Q9BQI5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms