Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNS3Q9BQ31 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms