Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT1Q99943 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms