Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP19Q99542 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms