Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAT1Q99536 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms